生物潔凈室，主要分為兩大類；一般生物潔凈室和生物學安全潔凈室。凈化工程設計人員通常接觸的是前者，它主要控制有生命微粒對操作人員的污染。在某種程度上說是增加滅菌處理工序的工業(yè)潔凈室。對工業(yè)潔凈室來說，采暖通風空調專業(yè)設計中，控制潔凈度級別的重要手段是通過過濾和正壓，對生物潔凈室來說除了采用工業(yè)潔凈室相同方法外，還需要從生物安全的角度，有時則需要采用負壓的手段來防止制品對環(huán)境的污染。

     近年來，生物制品發(fā)展很快，在諸多藥廠設計中也逐步涉及生物制品的領域。生物學安全潔凈室，主要用于科學試研和生物產品的開發(fā)。生物制品是藥品中的一大類別，是以微生物寄生蟲的毒素及生物組織作為起始材料，采用分離純化技術或生物學工藝制備，以生物學技術和分離技術控制間產物和成品質量制成的活性制劑。

    在制品生產過程中涉及高危致病因子的操作，其空氣凈化系統等設施還應符合特殊要求。生物安全潔凈室與工業(yè)潔凈室所不同的是首先要保證操作區(qū)維持負壓狀態(tài)，盡管此類生產區(qū)的級別不是很高，但會有較高的生物危險度級別。關于生物危險度，在我國 WTO 及世界其他國家均有相應標準。 通常采用的措施為二次隔離，首先由安全柜或隔離箱，將病原體與操作者一次隔離，主要是阻止危險微生物外溢的一道屏障。二次隔離是將實驗室或工作區(qū)變?yōu)樨搲簠^(qū)與外界的隔離。對于空氣凈化系統也相應采取一定的措施，如室內維持負壓30Pa~10Pa，并與相鄰非潔凈區(qū)之間設置負壓緩沖區(qū)。